Die Restaurierung und der Wiederaufbau des Kartäuser-Klosters von Valbonne wurde im Jahr 1789 zur Zeit der französischen Revolution beendet. Einmal mehr wurde das Leben im Kloster von der Geschichte brutal unterbrochen. Als die Besitztümer der Kirche entsprechend einem Erlass am 1. November 1789 an das Volk übergingen, wurde das weltliche Vermögen des Klosters zum nationalen Eigentum.

Als die Orden per Erlass am 13. Februar 1790 abgeschafft wurden, wurden die Mönche aus den Klöstern vertrieben. Der letzte Mönch verließ Valbonne am 1. Oktober 1790.

Für alle französischen Klöster wurden von den Gemeinderäten Inventuren durchgeführt. Das Chartreuse de Valbonne war das einzige Kloster, das nicht verkauft wurde, da darin eine Schule untergebracht werden sollte.

Als dieses Projekt fehlschlug, wurde das Kloster samt seiner landwirtschaftlichen Nutzfläche am 17. Februar 1804 per Erlass an das Hospital von Pont-Saint-Esprit übereignet, um dieses für den Verlust seines Vermögens zu entschädigen, das in nationales Eigentum überging.
 
1822 teilte die Kommission, die mit der Verwaltung des Kartäuser-Klosters beauftragt war, mit, dass das Kloster von den umliegenden Ortschaften geplündert wurde. Daraufhin wurde eine Auktion abgehalten, bei der das Kloster vom Kartäuser-Orden für die Summe von 65300 Francs zurück ersteigert wurde.

Das Chartreuse de Valbonne konnte wieder einmal aus seiner Asche auferstehen. Die Restaurierung und Wiederaufbau folgten. Die Familienkapelle und die Kapelle der Relikte stammen aus dieser Zeit. Das Kloster erlebte einen neuen Aufschwung: Im inneren ertönten wieder gregorianische Kirchenlieder, die Felder wurden erneut kultiviert, die Ställe wurden gefüllt und die Herden aufgestockt. Wie in der Vergangenheit waren Fremde und Arme willkommen und das Kloster schien wieder eine gloreiche Zukunft zu haben.

Gerade als das Kartäuser-Kloster, dessen einziges Bestreben im Erlangen von Frieden, Beschaulichkeit und Stille für Gebete und Meditation lag, seine Lebendigkeit und Heiterkeit wieder erlangte, brach auf Staatsebene ein heftiger Disput über den "Laienerlass" aus . Das am 1. Juli 1901 verabschiedete Combes-Gesetz stellte religiöse Gemeinden unter die Kontrolle des Staates, der diese entsprechend ihrer Nützlichkeit legitimierte - oder nicht legitimierte. Sowohl die Mönche von Valbonne als auch die Mönche der anderen Kartäuser-Klöster wurden in das Exil vertrieben, als sie sich weigerten, sich dem Gesetz zu unterwerfen. Die Mönche gingen nach Spanien, wo sie das Kloster Aula Dei neu begründeten, das während der zwei Belagerungen von Saragossa durch Napoleon Bonaparte teilweise zerstört wurde.

Dieses Mal mussten die Mönche ihr Heim endgültig aufgeben. Dom Gorce, der letzte Prior, verließ Valbonne am 30. September 1901.
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